Группа теоретической химии (№24) ИОХ РАН: Difference between revisions
From TheorChemGroup at ZIOC RAS
m (Исправил число школьников)  | 
				Medvedev MG (talk | contribs)   (+ последние публикации)  | 
				||
| Line 3: | Line 3: | ||
Основные направления наших научных исследований и ключевые публикации по ним:  | Основные направления наших научных исследований и ключевые публикации по ним:  | ||
# Моделирование химических процессов: моделирование химических реакций ([https://doi.org/10.1021/acs.joc.4c00233 JOC2024], [https://doi.org/10.1021/acs.joc.3c01415 JOC2023], [https://doi.org/10.1021/acs.oprd.3c00142 OPRD2023], [https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/ejoc.202200547 EJOC2022], [https://doi.org/10.1021/jacs.2c00406 JACS2022], [https://doi.org/10.1021/jacs.1c02249 JACS2021], [https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/jacs.0c06294 JACS2020], [http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.201706756/abstract ANIE2017]), биологических процессов ([https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.2c01212 JCIM2023], [http://dx.doi.org/10.1021/jacs.6b13243 JACS2017]), фотохимических процессов ([https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/chem.202203949 ChemEur2023], [https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0143720822002662 D&P2022], [http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0143720818317844 D&P2019]), электрохимических процессов ([https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2024/qo/d4qo01296h OrgChemFront2024]), а также процессов в твёрдом теле ([https://doi.org/10.1021/acs.jpclett.1c03288 JPCLett2021]).  | # Моделирование химических процессов: моделирование химических реакций ([https://www.tetrahedron-chem.com/article/S2666-951X(24)00054-8/fulltext TetrahedChem2024], [https://doi.org/10.1021/acs.joc.4c00233 JOC2024], [https://doi.org/10.1021/acs.joc.3c01415 JOC2023], [https://doi.org/10.1021/acs.oprd.3c00142 OPRD2023], [https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/ejoc.202200547 EJOC2022], [https://doi.org/10.1021/jacs.2c00406 JACS2022], [https://doi.org/10.1021/jacs.1c02249 JACS2021], [https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/jacs.0c06294 JACS2020], [http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.201706756/abstract ANIE2017]), биологических процессов ([https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.2c01212 JCIM2023], [http://dx.doi.org/10.1021/jacs.6b13243 JACS2017]), фотохимических процессов ([https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/chem.202203949 ChemEur2023], [https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0143720822002662 D&P2022], [http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0143720818317844 D&P2019]), электрохимических процессов ([https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2024/qo/d4qo01296h OrgChemFront2024]), а также процессов в твёрдом теле ([https://doi.org/10.1021/acs.jpclett.1c03288 JPCLett2021]).  | ||
# Развитие методов теоретической химии; к данному направлению относится как тестирование существующих методов ([https://doi.org/10.1021/acs.jpclett.3c03540 JPCLett2024], [https://www.science.org/doi/full/10.1126/science.abq3385 Science2022], [https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2021/cs/d1cs00564b ChemSocRev2021], [http://science.sciencemag.org/content/355/6320/49 Science2017]), так и создание новых ([https://doi.org/10.1021/acs.jcim.3c02040 JCIM2024  | # Развитие методов теоретической химии; к данному направлению относится как тестирование существующих методов ([https://doi.org/10.1021/acs.jpclett.3c03540 JPCLett2024], [https://www.science.org/doi/full/10.1126/science.abq3385 Science2022], [https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2021/cs/d1cs00564b ChemSocRev2021], [http://science.sciencemag.org/content/355/6320/49 Science2017]), так и создание новых ([https://doi.org/10.1021/acs.jcim.3c02040 JCIM2024], [https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.2c01212 JCIM2023], [http://doi.org/10.1016/j.mencom.2017.05.002 MendComm2017]), а также разработка общих подходов для дизайна новых методов ([https://doi.org/10.1021/acs.jpca.4c05085 JPCA2024], [https://wires.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/wcms.1690 WCMS2023]) и доработка программных комплексов под наши задачи ([https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0959943621001188 MendComm2021]). Под методами теоретической химии мы понимаем любые инструменты, используемые в направлении 1: методы DFT, силовые поля, базисные наборы, методы конформационного поиска, методы автоматизации молекулярного моделирования и т.д.  | ||
# Приложение методов искусственного интеллекта к химическим задачам: как к ускорению/уточнению молекулярного  моделирования ([https://www.science.org/doi/full/10.1126/science.abq3385 Science2022]), так и к другим задачам, возникающим в ходе химических исследований, как например ретросинтез ([http://chem-predictor.isc-ras.ru/reaction/retro_oli/ наша разработка] в рамках мегагранта ИХР РАН) или корректировка показаний детектора ([https://doi.org/10.1021/acsapm.4c01394 ACSApplPolyMat2024]).  | # Приложение методов искусственного интеллекта к химическим задачам: как к ускорению/уточнению молекулярного  моделирования ([https://www.science.org/doi/full/10.1126/science.abq3385 Science2022]), так и к другим задачам, возникающим в ходе химических исследований, как например ретросинтез ([http://chem-predictor.isc-ras.ru/reaction/retro_oli/ наша разработка] в рамках мегагранта ИХР РАН) или корректировка показаний детектора ([https://doi.org/10.1021/acsapm.4c01394 ACSApplPolyMat2024]).  | ||
# Моделирование процессов взаимодействия между нейронами; этот класс проектов не имеет прямого отношения к химии и появился из нашего интереса к пониманию процессов мышления и нейроморфным процессорам. В целом, тут есть два поднаправления: создание нейроморфных сетей для проектов направлений 2 и 3, и углубление нашего понимания того, как работает человеческий мозг. В рамках этого направления мы строим модели спайковых нейронных сетей (таких как в мозге) и смотрим на общие закономерности в их работе и обучении.  | # Моделирование процессов взаимодействия между нейронами; этот класс проектов не имеет прямого отношения к химии и появился из нашего интереса к пониманию процессов мышления и нейроморфным процессорам. В целом, тут есть два поднаправления: создание нейроморфных сетей для проектов направлений 2 и 3, и углубление нашего понимания того, как работает человеческий мозг. В рамках этого направления мы строим модели спайковых нейронных сетей (таких как в мозге) и смотрим на общие закономерности в их работе и обучении.  | ||
Revision as of 20:25, 8 December 2024
В настоящий момент в Группе работают 4 научных сотрудника, 10 аспирантов, 68 студентов из Москвы (МГУ, РХТУ, НИУ ВШЭ, МГТУ, РУДН, МФПУ), Тулы (ТулГУ) и Санкт-Петербурга (ИТМО), а также 2 школьника.
Основные направления наших научных исследований и ключевые публикации по ним:
- Моделирование химических процессов: моделирование химических реакций (TetrahedChem2024, JOC2024, JOC2023, OPRD2023, EJOC2022, JACS2022, JACS2021, JACS2020, ANIE2017), биологических процессов (JCIM2023, JACS2017), фотохимических процессов (ChemEur2023, D&P2022, D&P2019), электрохимических процессов (OrgChemFront2024), а также процессов в твёрдом теле (JPCLett2021).
 - Развитие методов теоретической химии; к данному направлению относится как тестирование существующих методов (JPCLett2024, Science2022, ChemSocRev2021, Science2017), так и создание новых (JCIM2024, JCIM2023, MendComm2017), а также разработка общих подходов для дизайна новых методов (JPCA2024, WCMS2023) и доработка программных комплексов под наши задачи (MendComm2021). Под методами теоретической химии мы понимаем любые инструменты, используемые в направлении 1: методы DFT, силовые поля, базисные наборы, методы конформационного поиска, методы автоматизации молекулярного моделирования и т.д.
 - Приложение методов искусственного интеллекта к химическим задачам: как к ускорению/уточнению молекулярного моделирования (Science2022), так и к другим задачам, возникающим в ходе химических исследований, как например ретросинтез (наша разработка в рамках мегагранта ИХР РАН) или корректировка показаний детектора (ACSApplPolyMat2024).
 - Моделирование процессов взаимодействия между нейронами; этот класс проектов не имеет прямого отношения к химии и появился из нашего интереса к пониманию процессов мышления и нейроморфным процессорам. В целом, тут есть два поднаправления: создание нейроморфных сетей для проектов направлений 2 и 3, и углубление нашего понимания того, как работает человеческий мозг. В рамках этого направления мы строим модели спайковых нейронных сетей (таких как в мозге) и смотрим на общие закономерности в их работе и обучении.
 
На данном вики-сайте находятся:
- Циклы курсов, разработанных и преподаваемых членами Группы, в том числе:
 - Закрытый раздел для сотрудников Группы.
 - Зеркала мануалов программ:
 
Наша группа


Полный список сотрудников Группы (номера курсов указаны на момент сентября 2024 г.):
- Медведев Михаил Геннадьевич - к.ф.-м.н, рук. гр. в ИОХ РАН, зав. лаб. в ИТМО, руководитель Группы
 - Цыкина Ксения Александровна - помощник руководителя Группы (e-mail: mmg-office@theorchem.ru)
 - Вельмискина Юлия Андреевна - аспирант ИОХ РАН, руководитель филиала Группы в ИОХ РАН
 - Джиблави Хадижа Билаловна - 3 курс ИнфоХим ИТМО, руководитель филиала Группы в ИТМО
 - Гуетнга Кристиан - 4 курс ТулГУ, руководитель филиала Группы в ТулГУ
 - Чалый Василий Антонович - аспирант ИОХ РАН, руководитель филиала Группы в МГТУ
 - Мезенцев Игорь Александрович - аспирант МГТУ, руководитель филиала Группы в ВШЭ, направления разработки методов цифровой химии и отдела преподавания
 - Проломов Илья Викторович - аспирант РХТУ, руководитель направления моделирования химических процессов
 - Артамонов Даниил Владимирович - 1 курс магистратуры-аспирантуры ИнфоХим ИТМО, руководитель нейроморфного направления
 - Дмитриенко Артём Олегович - к.х.н., с.н.с. ХФ МГУ
 - Цветков Владимир Борисович - к.х.н., с.н.с. ИНХС РАН
 - Рыжов Антон Николаевич - к.х.н., м.н.с. ИОХ РАН
 - Панова Мария Вячеславовна - инж.-иссл. ИОХ РАН
 - Малышев Вадим Игоревич - аспирант ИОХ РАН
 - Кривощапов Николай Владиславович - аспирант ИОХ РАН
 - Куницын Артём Юрьевич - аспирант ИОХ РАН
 - Злобин Иван Сергеевич - аспирант МФТИ
 - Елисеев Егор Александрович - аспирант МГУ
 - Ильин Егор Александрович - аспирант МГУ
 - Герасимов Игорь Сергеевич - MSc, Research Assistant at Budapest University of Technology and Economics
 - Тимашев Владимир Игоревич - 6 курс ХФ МГУ
 - Лосев Тимофей Валерьевич - 6 курс ХФ МГУ
 - Халыков Руслан Али Искандер оглы - 6 курс ХФ МГУ
 - Вергун Сергей Сергеевич - 6 курс ХФ МГУ
 - Кротков Никита Алексеевич - 6 курс ИнфоХим ИТМО
 - Ермолин Данила Владимирович - 6 курс ИнфоХим ИТМО
 - Ашина Юлия Сергеевна - 2 курс магистратуры ИнфоХим ИТМО, постдокторант СПбГУ
 - Исакова Анастасия Михайловна - 2 курс магистратуры ИнфоХим ИТМО
 - Зарипов Данис Уралович - 1 курс магистратуры AI Talent Hub ИТМО
 - Епифанов Евгений Юрьевич - 1 курс магистратуры ИСИЭЗ ВШЭ
 - Леонов Антон Вячеславович - 5 курс ХФ МГУ
 - Кручинин Тимофей Вячеславович - 5 курс ХФ МГУ
 - Кликушин Александр Сергеевич - 5 курс ВХК РАН
 - Попов Всеволод Олегович - 5 курс ВХК РАН
 - Баширов Игорь Игоревич - 4 курс ХФ МГУ
 - Беспалов Иван Андреевич - 4 курс ХФ МГУ
 - Шнайдер Марк Юрьевич - 4 курс ХФ МГУ
 - Долотказин Магди Сергеевич - 4 курс ХФ МГУ
 - Гареев Руслан Олегович - 4 курс ВМК МГУ
 - Быкова Софья Константиновна - 4 курс ВХК РАН
 - Трифонова Елена Николаевна - 4 курс ХФ ВШЭ
 - Антропова Ольга Николаевна -4 курс ХФ ВШЭ
 - Хань Линь До - 4 курс ХФ ВШЭ
 - Ломаев Данил Дмитриевич - 4 курс ХФ ВШЭ
 - Ахундзянова Александра Олеговна - 4 курс ИнфоХим ИТМО
 - Гречихин Никита Алексеевич - 4 курс ТулГУ
 - Тюрин Артём Владимирович - 4 курс МГТУ
 - Бреннер Николай Константинович - 4 курс СМ МГТУ
 - Садиллоев Шахруз Хайриллоевич - 4 курс СМ МГТУ
 - Антаньязов Михаил Романович - 3 курс ХФ МГУ
 - Гуторова Нина Дмитриевна - 3 курс ХФ МГУ
 - Варакин Сергей Леонидович - 3 курс ХФ МГУ
 - Клочков Иван Владимирович - 3 курс ХФ МГУ
 - Лущеев Семён Ильич - 3 курс ФФХИ МГУ
 - Бекмансуров Данис Рашидович - 3 курс ВХК РАН
 - Ротова Екатерина Андреевна - 3 курс ВХК РАН
 - Кычков Устин Григорьевич - 3 курс ХФ ВШЭ
 - Василенко Софья Александровна - 3 курс ХФ ВШЭ
 - Муллагалин Тимур Айдарович - 3 курс ХФ ВШЭ
 - Тюкина Софья Павловна - 3 курс ХФ ВШЭ
 - Иванов Илья Денисович - 3 курс ИнфоХим ИТМО
 - Овчинников Петр Александрович - 3 курс ИнфоХим ИТМО
 - Ботова Софья Александровна - 3 курс ИнфоХим ИТМО
 - Кожинов Павел Сергеевич - 3 курс ИнфоХим ИТМО
 - Радченко Максим Евгеньевич - 3 курс ИнфоХим ИТМО
 - Малашкеевич Ксения Михайловна - 3 курс ЦиТХИн РХТУ
 - Дворжанская Александра Владленовна - 3 курс ХФТ РХТУ
 - Лукичев Алексей Павлович - 2 курс ХФ МГУ
 - Васильев Андрей Владимирович - 2 курс ХФ ВШЭ
 - Демехин Максим Андреевич - 2 курс ИнфоХим ИТМО
 - Васильева Мария Денисовна - 2 курс ИнфоХим ИТМО
 - Бондарев Алексей Игоревич - 2 курс ИнфоХим ИТМО
 - Бетехтин Артём Андреевич - 2 курс ИнфоХим ИТМО
 - Дударь Илья Алексеевич - 2 курс ИнфоХим ИТМО
 - Воробьев Степан Андреевич - 2 курс ИнфоХим ИТМО
 - Авдеенко Марьяна Дмитриевна - 2 курс ФМиЕН РУДН
 - Овсянникова Юлия Павловна - 1 курс ХФ МГУ
 - Андреенко Ирина Владиславовна - 1 курс ХФ ВШЭ
 - Жуков Роман Олегович - 1 курс ИнфоХим ИТМО
 - Биктимиров Ильдар Альбертович - 1 курс ИнфоХим ИТМО
 - Чепкасова Дарья Алексеевна - 1 курс НПМ РХТУ
 - Буланова Наталия Викторовна - 1 курс ТНВиВМ РХТУ
 - Новосёлова Полина - ученица 11 класса Московского Химического Лицея №1303
 - Романов Кирилл - учащийся 10 класса Московского Химического Лицея №1303
 - Веселов Игорь Александрович - ИнфоХим ИТМО (академ.)
 - Зиновьева Анастасия Александровна - МФПУ (академ.)
 - Верёвкин Даниил Владимирович - выпускник ТулГУ
 - Гранцев Михаил Анатольевич - выпускник МИЭМ НИУ ВШЭ
 
Наши открытые онлайн-ресурсы
- Открытый раздел Вики
 - TheorChem News - открытый канал в Телеграме, используемый для важных объявлений, касающихся нашей Группы.
 - TheorChem GitHub - GitHub аккаунт нашей Группы, на котором доступны разработанные нами открытые программные продукты, а также используемый в наших публикациях код.
 - TheorChem Library - открытый канал в Телеграме, в котором мы обмениваемся интересными цитатами из статей и слайдами с конференций. (инструкция по получению доступа к публикации)
 - TheorChem Shiny - shiny-R-сервер нашей Группы, на котором доступны разработанные нами интерактивные веб-приложения. (в работе)
 
- Science Thought Library - Chemistry, сокращ. SciTL_Chem - открытая для всех версия Lab24 Library; чтобы получить возможность публиковать в нём посты, смотрите вики-страницу SciTL_Chem. Данный канал является спутником конференц- и книжного клубов ИОХ РАН. В нём публикуются (не сами собой, а нами и вами) интересные слайды с конференций, важные цитаты из книг и статей, а также мысли по ним.
 
Про нашу работу понятным языком
На русском языке
- Интервью Медведева М.Г., связанные с проектом "Вычисление функционала плотности (DFT) с помощью нейроморфных сетей" конкурса BlueSky Research в 2022 году [InScience, Indicator]
 - Интервью аспирантов Группы в декабре 2022 для сайта ИОХ [В.И. Малышев, Н.В. Кривощапов]
 - Пресс-релизы, связанные с публикацией комментария в Science в 2022 году [ТАСС.Наука, Habr]
 - Интервью Медведева М.Г. в 2021 г. при создании Группы в ИОХ РАН
 - Пресс-релизы, связанные с публикацией статьи в Science в 2017 году [ТАСС.Наука, Indicator]
 
Press-releases and interviews in English
- Press-releases related to our Comment in Science in 2022 [EurekAlert, Phys.org, funny interpretation by T. Greene]
 - Press-releases related to our Article in Science in 2017 [EurekAlert, NatRevChem, Phys.org, ChemEurope]