CCC:HomeWork2

Задачей данного практического задания является нахождение наиболее стабильного переходного состояния (ПС) в сложной реакции S_N2 замещения CN на Cl в модельном диоле:

Модельная реакция

Очевидно, что в данном случае обе OH-группы могут образовывать водородные связи с первым или вторым нуклеофилом (они оба имеют частичный отрицательный заряд в ПС). Поэтому предсказать, как будет выглядеть переходное состояние, очень сложно. Но это можно установить, проведя конформационный поиск ПС и локализовав все конформеры ПС с помощью квантовохимических расчётов.

Для конформационного поиска ПС мы будем использовать разработанный Медведевым М.Г. и Пановой М.В. алгоритм, в котором изменяющиеся (разрывающиеся или замыкающиеся) связи зафиксированы (законстрейнены) на длинах, близких к реализующимся в переходных состояниях:

Общая идея алгоритма конформационного поиска ПС

Найденные эмпирическим путём оптимальные величины констрейнов

Связь	Величина констрейна
H ... 2nd row atom	1.4 Ангстрем
2nd row atom ... 2nd row atom	2.0 Ангстрем
2nd row atom ... 3rd row atom	2.3 Ангстрем

, что для связей H...2ndRow оптимальная длина констрейна

Процесс выполнения: